поменять наименование по заявлению собственника через МФЦ (или через окно Росреестра, в общем, куда тех.планы сдаете, туда и заявление)
Например, оставьте просто «объект индивидуального жилищного строительства»

А зачем вообще менять наименование?!.. назначение- жилой дом, все налоги, возможным требования и прочие проблемы, какие могут возникнуть, будут отталкиваться именно от назначения, а оно у вас не меняется. К слову, на каком-то семинаре товарищи из центрального аппарата вели речь о том, что в планах у этого самого аппарата, вообще убрать характеристики «наименование» из сведений ЕГРН, но это так, на уровне слухов…
Но если сильно надо- по предложению alena_baqqq (по заявлению собственника)точно не пройдет. Изменение характеристик ЕГРН (кроме назначения) производится на основании техплана.
И вот тут возникает проблема: потому что техплан- то Вы на основании чего делать будите?! Раньше ( когда решение принимала кадастровая), этот момент был утресен- делаем техплан на основании декларации, в которой собственник прописывал новое наименование, и все всех устраивало. Но теперь когда решение за регистраторами- у нас такая тема уже не проходит… То, как это видят наш РР — это отдельная тема, и думаю, что в разных регионах практика разнится… А в связи с этим и возвращаемся к первому вопросу: зачем все- таки надо менять наименование и стоит ли оно того?!..