Странно проект составлен)))) хочешь делай так, а хочешь эдак… зачем тогда он нужен, такой проект))…
Но Техплан Вы делаете не только на основании проекта, но и разрешительной документации- акт приемки законченного объекта (из которого берете протяженность фактическую), еще бывает выдают исполнительные съемки на построенную трубу, еще паспорт газопровода. Так что по совокупности этих документов решаете как показывать объект, и соответственно, Если труба попадает на участок, тогда соглашение с собственником надо, а если есть возможность не показывать этот кусок трубы, то нет.

Проект и действительно странный, проектировщики очень не профессионально поступили — я вот тут написал, а там сами разберетесь. Ну да ладно, проблему надо решать).
Была практика, когда объект построен (акт приемки есть с датой окончания строительства), а регистрировать по разным причинам идем через год-два. Прописывали в заключение КИ, что в период создания объекта недвижимости участка не было на учете и знать мы о нем не могли, и о намерениях уточняться тоже. Был еще опыт, когда просто согласие брали в письменной форме (эти участки принадлежали как раз тем, к кому эти вводы тянем или соседи, которым объясняли как это важно). Закон обязывает подтвердить факт наличия права у строителей в период создания объекта недвижимости, а то, что после строительства возникло — момент спорный.