Внесите сведения через учет изменений о земельном участка на котором расположен дом в кад паспорт дома, а затем обращайтесь за регистрацией права на земельный участок. ЗК РФ ст. 1. п. 5 (единство судьбы земельных участков и прочно связанных с ними объектов, согласно которому все прочно связанные с земельными участками объекты следуют судьбе земельных участков, за исключением случаев, установленных федеральными законами).

проблема может возникнуть на стадии регистрации права.

Как вариант. Ставьте на кад учет квартиру по правоустанавливающему («документу о приватизации») документу и по нему же регистрируйте право. Скорее всего площадь увеличилась за счет печи или другой перепланировки и если понесёте техпаспорт бти нужно будет узаконить и перепланировку, а это вы всегда успеете сделать позже.