Скорее всего да, т.к. сейчас утверждаются проекты, которые устанавливают переходные периоды для МП и ТП, подготовленных до 1 января, — до 1 июля, по аналогии, наверное, и МП с датой до 1 декабря можно будет сдавать. Но это же редко возможно при наличии документов в составе МП/ТП с более поздними датами.

В действующем законодательстве вроде нет оснований для отказа во внесении данных сведений из-за пересечений с границами объектов недвижимости, если с документом всё хорошо. Максимум — пишут замечания и комментарии в уведомлениях о внесении, а всякие местные проверки и согласования с Росреестром — до недавнего времени были самодеятельностью, если вдруг недавно что-то изменилось — могла упустить, но сомневаюсь.

Координаты-то там одни, а вот появление третьего колышка — вполне возможно, но всё же вероятность того, что он будет стоять не далее, чем 20 см от какого-то из существующих двоих — стремится к 100%.
Рассказывали коллеги подобный случай, когда в забытой всеми деревушке образовался спор за межу, вынесли точно так же — два колышка примерно в метре друг от друга и примерно равноудаленных от фактической межи, один работал в RTK, второй — тоже не как зря, отстоял статику и вынес от неё тахеометром, в результате возникло недопонимание, один из исполнителей уехал, деды-соседи решили позвать третьего, и второй коллега остался посмотреть. Тут же примчался паренёк со столетним оптическим теодолитом, выслушал спорщиков, оценил ситуацию, посмотрел в теодолит, понаводился на колья и, прищурившись, поставил свой колышек точно посередине, прямо на существующей меже.
Деды возликовали и выдвинули вердикт, что вот он — настоящий геодезист, а не шарлатан, как некоторые, которые только и умеют на кнопки нажимать, оставшегося коллегу изгнали с позором, а хитрого паренька тут же пригласили поучаствовать в распитии мировой прямо там на меже)
Звучит как анекдот, но в версии моего рассказчика назывались имена известных мне людей, которых я немножко знаю и которые в принципе могли быть действительными участниками такой вот истории.

СРО может, и все очень ждут, когда СРО начнут контролировать средства и методы измерения, которые КИ применяют в своей работе, очень рекомендую к ним обратиться.
И ещё советую обратиться к каждому из специалистов, которые выполняли вынос, и попросить предоставить схему геодезических построений или хотя бы документ, в соответствии с которым им были выданы пункты геодезической основы, только по-хорошему. Скорее всего, те, кто работает качественно, все объяснят и постараются вам помочь, я в актах выноса, например, пишу, от каких пунктов развивалось обоснование, на случай таких вопросов у коллег. В случае конкретного отказа — конечно против коллег сейчас скажу, но пригрозите жалобой в Росреестр и просьбой провести проверку геонадзора, это неприятная штука и каждый предпочтет лучше перепроверить себя и выяснить между собой, кто не прав, они очень просто могут это сделать — встретиться возле любого из пунктов с известными координатами, им этого будет достаточно.
Если срочно — действительно пригласите третьего кадастрового инженера из какой-нибудь крупной организации, а потом вернете деньги у тех, кто допустил ошибку.
Но имейте в виду, что этот вид деятельности сейчас абсолютно на 100% неурегулирован, и контролировать можно — только качество измерений вообще, а не процесс выноса и оформление документации.
А вообще обидно оказаться на месте тех, кто работу выполнил качественно — кто-то косячит и набивает карманы, а ты трать время из-за них на контрольные измерения и выслушивай претензии и недовольства(